Einige Minuten vor dem Zeitpunkt von Sonnenaufgang bzw. Sonnenuntergang beginnt man, das Agnihotra-Feuer wie folgt vorzubereiten. 

Legen Sie ein flaches Stück des getrockneten Kuhdungs auf den Boden der Kupferpyramide. Dann bestreichen Sie mehrere Stücke Kuhdung mit Ghee und ordnen Sie sie so in der Pyramide an, daß in der Mitte etwas Platz ist und daß Luft zirkulieren kann. Jetzt geben Sie etwas Ghee auf ein kleines Stück Kuhdung, zünden es an und legen es in die Mitte der anderen Kuhdungstückchen. So wird bald der gesamte Dung anfangen zu brennen. Man kann mit einem Handfächer der Flamme Luft zufächeln, daß sie besser brennt. Aber man sollte nicht in die Flamme blasen, weil sonst Bakterien in das Feuer gelangen können.

Verwenden Sie keine Mineralölprodukte zum Anzünden des Feuers (etwa in Benzin- oder Gasfeuerzeugen) - dies würde die Atmosphäre verunreinigen.  Zum Zeitpunkt von Sonnenaufgang bzw. Sonnenuntergang sollte bereits eine schöne Flamme in der Pyramide brennen.  Sie geben einige Körner Reis in ein Gefäß oder auf die linke Handfläche (oder in ein Kupferschälchen) und vermischen Sie diese mit ein paar Tropfen Ghee.  Genau zum Zeitpunkt des Sonnenaufgangs singt man das erste der Morgen-Mantras und gibt nach dem Wort ”SWAHA” die erste Portion Reis mit der rechten Hand in das Feuer (eine Fingerspitze voll genügt).  Dann singt man das zweite Mantram und gibt nach dem Wort ”SWAHA” die zweite Portion Reis mit der rechten Hand ins Feuer. Damit ist das Morgen–Agnihotra beendet.  Bei Sonnenuntergang verwendet man die Abend–Agnihotra-Mantras und verfährt ansonsten gleich.  Wenn man den exakten Zeitpunkt von Sonnenaufgang bzw. Sonnenuntergang verpaßt, ist es kein Agnihotra. Man erzielt weder den reinigenden Effekt auf die Atmosphäre, noch wirkt die Asche heilsam. 

Agnihotra schafft eine gereinigte, heilende Atmosphäre.  Versuchen Sie deshalb, nach jedem Agnihotra so viel Zeit wie möglich zur inneren Einkehr oder Meditation zu nutzen. Zumindest können Sie solange dabei sitzen, bis das Feuer ausgeht. Die Asche nimmt man am besten erst direkt vor dem nächsten Agnihotra aus der Pyramide und gibt sie in ein Glas oder ein Tongefäß. Man kann sie den Pflanzen geben oder sie als Naturheilmittel verwenden.